В 1980 г. окончил исторический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова. С 1985 г. по настоящее время - в Институте этнологии и антропологии им. Н.Н. Миклухо-Маклая РАН. С 1989 г. (с перерывом на докторантуру) - заместитель директора Института. Заместитель главного редактора журнала «Этнографическое обозрение». В 1986 г. защитил кандидатскую диссертацию «Этнокультурные процессы в резервациях индейцев США в современный период». В 1996 г. защитил докторскую диссертацию «Распад Советского Союза: этнополитический анализ».

Автор более 50 публикаций, в том числе монографий:

• Стельмах В.Г., Тишков В.А., Чешко С.В. Тропою слез и надежд (Книга о современных индейцах США и Канады). М., 1990.
• Коренное население Северной Америки в современном мире (коллективная монография) // Под ред. В.А. Тишкова. М., 1990.
• Чешко С.В. Идеология распада. М., 1993.
• Чешко С.В. Распад Советского Союза: этнополитический анализ. М., 1996; 2-е изд.: М., 2000.